WORKSHOP SUB-TIPAGEM MOLECULAR

subtipagem

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Sub-tipagem Molecular e Análise de Sequências Genômicas Aplicadas à Estudos de Micro-organismos Patogênicos
Dr. Renato HohlOrsi, Ph.D.

Department of Food Science - College of Agriculture and Life Scienc Carnell University - EUA

12 a 16 de Maio de 2014
Faculdade de Engenharia de alimento UNICAMP

Dr. Renato HohlOrsi, Ph.D. Department of Food Science
College of Agriculture and Life Sciences Cornell University, EUA .
SOBRE O DOCENTE:
Renato Hohl Orsi, Ph.D. possui Bacharelado em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (2001), Licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (2001), Mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (2003), Ph.D. em Microbiologia pela Cornell University (2007) e pós doutorado no Departamento de Ciências de Alimentos na Cornell University (2010). Entre 2011 e 2012 atuou como pesquisador associado no mesmo departamento e a partir de 2013 tornou-se Professor Assistente de Cortesia. Dr Orsi tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Molecular e de Micro-organismos, atuando principalmente nos seguintes temas: evolução, genômica comparativa, epidemiologia, análise genômica da expressão genica através de microarray e sequenciamento de RNA (RNA-Seq), e segurança de alimentos, tendo trabalhado com os seguintes micro -organismos: Listeriamonocytogenes, Salmonella e Escherichia coli.

OBSERVAÇÕES QUANTO ÀS INSCRIÇÕES:
Em caso de desistência /cancelamento por parte do interessado:
- O cancelamento deve ser feito através do e-mail contato@lmqa.com.br, para registro da data. Não serão aceitos cancelamentos via telefone, SMS ou redes sociais.
- Será devolvido 30% do valor pago pela inscrição em casos de cancelamento feito entre 14 dias e 5 dias antes do início previsto do workshop.
- Não será devolvido o valor pago pela inscrição em caso de cancelamentos feitos a partir de 4 dias antes do início previsto do workshop.

WWW.FEA.UNICAMP.BR
FEA - Faculdade de Engenharia de Alimentos
Laboratório de Microbiologia Quantitativa de Alimentos
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Cidade Universitária "Zeferino Vaz" Barão Geraldo - Campinas - SP - CEP.: 13083-862 contato@lmga.combr - (19)3521-0091

SUB-TIPAGEM MOLECULAR E ANÁLISE - DE SEQUÊNCIAS GENÔMICAS APLICADAS À ESTUDOS DE MICRO-ORGANISMOS PATOGÊNICOS

EMENTA DO WORKSHOP
O workshop tem por objetivo introduzir aos participantes noções gerais de sub-tipagem molecular, incluindo a apresentação de diversas ferramentas de sub-tipagem, explicação das bases biológicas por trás da utilização destas ferramentas, interpretação de resultados e prática na utilização da técnica de MLST ("MultiLocusSequenceTyping"). Além disso, os participantes serão apresentados e aprenderão a utilizar diversos bancos de dados contendo sequências de DNA e proteínas, serão introduzidos às características gerais de um genoma bacteriano e às formas de anotação destes genomas, e utilizarão ferramentas de bioinformática para a manipulação de genomas e análises comparativas com outros genomas. Por fim, os participantes serão apresentados a conceitos de genômica funcional e aprenderão a utilizar as ferramentas disponíveis no sítio BioCyc para a análise funcional de genomas. Os participantes poderão trazer seus próprios genomas que desejam analisar ou poderão utilizar genomas pré-selecionados pelo workshop. As aulas serão teóricas e práticas, em laboratório de informática.

INFORMAÇÕES
Inscrições de 24/02/2014 até 09/05/2014
Data: 12 a 16 de Maio de 2014.
Horários 8h às 12h e 14h às 18h.
Local Salão Nobre, FEA - Faculdade de Engenharia de Alimentos, UNICAMP

INVESTIMENTO
Teórico
R$ 955,00 - Inscrições até 10/04/14
R$ 1.150, - Inscrições a partir de 11/04/14

Teórico - Prático
R$ 1.250,00 Inscrições até 10/04/14
R$ 1.350,00 - Inscrições a partir de 11/04/14

Agenda
Data/ Horário / Aula / Conteúdo

12/05/2014 8:00-9:00 (Teórica) Introdução, revisão sobre DNA, RNA, replicação, transcrição, genes e estrutura do genoma.
12/05/2014 9:00-10:00 (Teórica) Conceitos evolutivos, diversidade e taxonomia microbiana. Sub-tipagem.
12/05/2014 10:00-12:00 (Teórica) Revisão de metodologias: ribotipagem, PCR, RFLP, PFGE.
12/05/2014 14:00-16:00 (Teórica) Revisão de metodologias: VNTR, MLVA, MLST, microarray, RT-PCR.
12/05/2014 16:00-18:00 (Teórica) Novas metodologias: amplificação isotermal, sequenciamento genômico, métodos independentes de cultura.

13/05/2014 08:00 – 10:00 (Teórica) Sequenciamento de DNA: crescimento, extração do DNA, desenho de primes, PCR, gel de eletroforese, sequenciamento, verificação, montagem de sequências maiores a partir de fragmento que se sobrepõem.
13/05/2014 10:00-12:00 (Teórica) Alinhamento de sequências, construção de árvores, análise evolutiva.
13/05/2014 14:00-16:00 (Prática)Construção de árvores e análise evolutiva.

14/05/2014 8:00-12:00 (Teórica - Prática) Bancos de dados de sequências/MLST/16S.
14/05/2014 14:00 – 18:00 (Teórica) Genomas - características e anotação.

15/05/2014 8:00-12:00Genomas - visualização e anotação utilizando ferramentas online e Artemis.
15/05/201414:00 – 18:00 (Teórico – Prático) Genômica comparativa.

16/05/2014 8:00-12:00 (Teórica) Genômica funcional: desvendando a função das proteínas e como elas interagem. Metabolomas.
16/05/2014 14:00-16:00 (Prática) Genômica funcional: Biocyc.

Sugestão de Hospedagens: aqui